Il riscaldamento delle batterie non dipende dalla durata di utilizzo del flash ma dal modo d'uso.
Mi spiego, puoi tenerlo acceso ore ed ore senza fare lampi e le batterie rimangono fredde, oppure usarlo x dieci minuti con lampi a piena potenza uno di seguito all'altro, in questo caso si scaldano parecchio.
Questo e' dovuto al picco di corrente richiesto dal flash che provoca una caduta di tensione sulla batteria che ha una resistenza serie. Resistenza serie che e' generalmente piu' piccola quanto maggiore e' la capacita' di corrente della batteria.
Conoscendo la resistenza serie delle batterie e la corrente media erogata dalle stesse e' possibile calcolare la potenza dissipata dalla batterie
P= R*Iquadro. Conoscendo anche la resistenza termica delle batterie si potrebbe addirittura calcolare la temperatura a cui si portano le batt. dopo un intenso uso.
Non vi tedio oltremodo con altre formule

solo teoria...
Concludendo, se usi batterie di maggiore amperaggio (e quindi minore resistenza serie) otterrai un minore riscaldamento delle stesse.
La cosa e' cmq normale, non ti preoccupare.
G